Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms