Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbbp8nlA2ABX0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp8nlA2ABX0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms