Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm884A2A9H6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm884A2A9H6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms