Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms