Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms