Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trbv21A0A0A6YX06 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Trbv21A0A0A6YX06 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv21A0A0A6YX06 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trbv21A0A0A6YX06 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv21A0A0A6YX06 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv21A0A0A6YX06 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv21A0A0A6YX06 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv21A0A0A6YX06 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv21A0A0A6YX06 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv21A0A0A6YX06 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trbv21A0A0A6YX06 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv21A0A0A6YX06 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trbv21A0A0A6YX06 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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