Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Y3

Ighv1-80, Immunoglobulin heavy variable 1-80 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv1-80A0A075B5Y3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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