Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BccipQ9CWI3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BccipQ9CWI3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BccipQ9CWI3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BccipQ9CWI3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BccipQ9CWI3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BccipQ9CWI3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BccipQ9CWI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BccipQ9CWI3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BccipQ9CWI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BccipQ9CWI3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BccipQ9CWI3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BccipQ9CWI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BccipQ9CWI3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BccipQ9CWI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BccipQ9CWI3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BccipQ9CWI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BccipQ9CWI3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BccipQ9CWI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms