Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GpnmbQ99P91 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GpnmbQ99P91 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GpnmbQ99P91 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GpnmbQ99P91 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GpnmbQ99P91 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms