Protein–RNA interactions for Protein: Q924W6

Trim66, Tripartite motif-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim66Q924W6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim66Q924W6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim66Q924W6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim66Q924W6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim66Q924W6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim66Q924W6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim66Q924W6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim66Q924W6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim66Q924W6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim66Q924W6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim66Q924W6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim66Q924W6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms