Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrp12Q6P5B0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrp12Q6P5B0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp12Q6P5B0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rrp12Q6P5B0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrp12Q6P5B0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rrp12Q6P5B0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms