Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp4Q61107 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gbp4Q61107 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp4Q61107 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp4Q61107 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp4Q61107 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp4Q61107 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms