Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cxcl5P50228 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cxcl5P50228 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcl5P50228 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl5P50228 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms