Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Col4a2P08122 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a2P08122 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a2P08122 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a2P08122 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a2P08122 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a2P08122 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a2P08122 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a2P08122 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a2P08122 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a2P08122 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a2P08122 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a2P08122 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a2P08122 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a2P08122 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a2P08122 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a2P08122 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.1 ms