Protein–RNA interactions for Protein: P05132

Prkaca, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacaP05132 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkacaP05132 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkacaP05132 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkacaP05132 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkacaP05132 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkacaP05132 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkacaP05132 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkacaP05132 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkacaP05132 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkacaP05132 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrkacaP05132 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkacaP05132 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkacaP05132 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkacaP05132 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms