Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm9602J3QPD5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm9602J3QPD5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9602J3QPD5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9602J3QPD5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9602J3QPD5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9602J3QPD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9602J3QPD5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm9602J3QPD5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm9602J3QPD5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm9602J3QPD5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms