Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rd3lB2RV38 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rd3lB2RV38 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rd3lB2RV38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rd3lB2RV38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rd3lB2RV38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms