Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms