Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rabgef1Q9JM13 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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