Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Col5a3Q9JLI2 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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