Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RabggtaQ9JHK4 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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