Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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