Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Dsg1bQ7TSF1 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Dsg1bQ7TSF1 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Dsg1bQ7TSF1 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Dsg1bQ7TSF1 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms