Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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