Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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