Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rpl28P41105 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms