Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Hoxd9P28357 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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Hoxd9P28357 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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