Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms