Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Hoxb1P17919 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxb1P17919 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxb1P17919 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxb1P17919 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxb1P17919 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxb1P17919 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxb1P17919 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxb1P17919 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Hoxb1P17919 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms