Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms