Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Cldn34c2J3QNM1 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
Cldn34c2J3QNM1 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
Cldn34c2J3QNM1 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Cldn34c2J3QNM1 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Cldn34c2J3QNM1 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Cldn34c2J3QNM1 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Cldn34c2J3QNM1 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Cldn34c2J3QNM1 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Cldn34c2J3QNM1 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Cldn34c2J3QNM1 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Cldn34c2J3QNM1 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms