Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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