Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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