Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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