Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Kcnn1Q9EQR3 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Kcnn1Q9EQR3 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 536.8 ms