Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccdc18Q640L5 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.6 ms