Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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