Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtpreP49446 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtpreP49446 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtpreP49446 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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