Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24205-201ENSMUST00000082953 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25405-201ENSMUST00000082973 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26496-201ENSMUST00000083150 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25790-201ENSMUST00000083293 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms