Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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