Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ggta1P23336 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ggta1P23336 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ggta1P23336 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ggta1P23336 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ggta1P23336 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms