Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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Ccl20O89093 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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Ccl20O89093 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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