Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Casq1O09165 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Casq1O09165 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Casq1O09165 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Casq1O09165 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Casq1O09165 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms