Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm379J3QQ19 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms