Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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Gm21887J3QQ04 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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Gm21887J3QQ04 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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Gm21887J3QQ04 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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Gm21887J3QQ04 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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Gm21887J3QQ04 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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Gm21887J3QQ04 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
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Gm21887J3QQ04 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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Gm21887J3QQ04 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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Gm21887J3QQ04 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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Gm21887J3QQ04 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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Gm21887J3QQ04 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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Gm21887J3QQ04 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm21887J3QQ04 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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