Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Usp9yF8VPU6 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Usp9yF8VPU6 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms