Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rd3lB2RV38 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms