Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col5a3Q9JLI2 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms