Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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