Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc18Q640L5 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc18Q640L5 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms